(๑) รับขึ้นทะเบียนและออกใบอนุญาตให้แก่ผูเขอเป็นผู้ประกอบวิชาชีพการแพทย์แผนไทย และการประกอบอาชีพการแพทย์แผนไทยประยุกต์
(๒) ออกคำสั่งตามมาตรา ๔๕
(๓) รับรองปริญญา ประกาศนียบัตร หรือ วุฒิบัตรในวิชาชีพการแพทย์แผนไทยของสถาบันต่างๆ เพื่อประโยชน์ในการสมัครเป็นสมาชิก
(๔) รับรองหลักสูตรสำหรับการฝึกอบรมเป็นผู้ชำนาญการในด้านต่างๆ ของวิชาชีพการแพทย์แผนไทยของสถาบันที่ทำการฝึกอบรมดังกล่าว
(๕) รับรองวิทยฐานะของสถาบันที่ทำการฝึกอบรมใน (๔)
(๖) ออกหนังสืออนุมัติ หรือ วุฒิบัตรแสดงความรู้ความชำนาญในการประกอบวิชาชีพการแพทย์แผนไทยและการประกอบอาชีพการแพทย์แผนไทยประยุกต์
(๗) จัดทำแผนการดำเนินงานและรายงานผลการดำเนินงานเสนอต่อสภานายกพิเศษอย่างน้อยปีละครั้ง
(๘) ดำเนินการให้เป็นไปตามวัตถประสงค์ของสภาการแพทย์แผนไทย
(๙) บริหารกิจการใดๆ ตามวัตถุประสงค์และอำนาจหน้าที่ตามพระราชบัญญัตินี้ ตลอดจนกิจการใดๆ ของสภาการแพทย์แผนไทย